تحديث نتيجة آل بهار

لقد تمّ، بحول الله، نقل ملف BAM الخاص بعينة آل بهار إلى شركة YFull وقراءته ومقارنته مع باقي العينات العلوية والقرشيّة. وتبيّن لنا أنّهم موجبون للتحوّر الحسيني FGC30416 وسالبون لجميع التحورات العوكلانيّة والأعرجيّة أدنى منه، والموجودة عندنا في المشجّر الجيني. مبارك لهم.

وتمّ نقل التحورات الخاصة لهذه العينّة إلى مكانها المناسب في المشجّر الجيني. وهذا تحديث إضافي لهيكليّته:

https://fgc8712.com/wp-content/uploads/2017/10/quraysh-tree-10212017.png

مواضيع متعلّقة: نتيجة آل بَهَار – ملوك الشعراء

تحديث من hg19 إلى hg38

لقد حدّثت شركة FTDNA من منظومة مواقع ChrY لديها واعتمدت الكيان الجديد hg38 بدلاً من الكيان القديم hg19. كذلك تمّ اعتماد هذا الكيان الجديد لدى مجتمع ISOGG الجيني وشركة YFull. هذا التغيير سيمنحنا المزيد من الدقة في قراءة التحورات، ولكنه سيغيّر مواقع الأخيرة كُلّياً على ChrY.

وبما أنّ شركة FGC لم تعتمد هذا التحديث إلى الآن (ونظنّها ستعتمده لاحقاً)، سنضّطر لإستعمال و عرض القراءتين القديمة والجديدة في آن معاً عند إنشاء المشجر الجيني.

ولمعرفة مواقع هذه التغيّرات في ChrY، يمكنكم قراءة هذا الرابط:

http://www.ytree.net/hg19tohg38.html

فعلى سبيل المثال، تتغيّر مواقع التحورات الخاصة بنا بين الكيانين (hg19 و hg38) على ChrY بالشكل التالي:

hg38 – الكيان الجديد   hg19 – الكيان القديم
15,272,075 17,383,955 FGC8712 / G > A
13,908,470 16,020,350 L859 / G > A
7,523,736 7,391,777 FGC8703 / A > G
20,706,147 22,868,033 FGC10500 / T > C
20,980,021 23,141,907 FGC30416 / T > C

ولتحويل مواقع تحوّرات ChrY كاملةً بين الكيانين hg19 و hg38، يمكنكم إستعمال هذا الرابط:

http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver

تعريف مصطلحات:

GRCh38 = Genome Reference Consortium Human Reference 38 = human genome 38 = hg38

GRCh Build 37 = hg19

مجتمع ISOGG الجيني:

http://ybrowse.org/gb2/gbrowse/chrY

إنضمام عيّنة Güemes

إنضمّت اليوم عيّنة آل Güemes للمشروع وهي تستعدّ حاليّاً لفحص الصحيفة الإبراهيميّة FGC8712. العيّنة لها تطابق مع الكثير من العيّنات العلوية وهي بعيدة نِسْبيّاً عن العيّنات المخزوميّة. وفحص الصحيفة لها مُهمّ جدّاً لفهم أصولها. استمر في القراءة

نتيجة عيّنة آل طباجة

ظهرت نتيجة عيّنة آل طباجة من جبل عامل (قضاء النبطيّة، والأصل قضاء مرجعيون) موجبة للتحور العلوي FGC10500 وسالبة للتحورات الحُسينيّة (FGC30416) والمحضيّة (FGC8702) والطباطبائيّة (CTS8308) والقرشيّة (ZS5448)، بحسب فحص صحيفة FGC8712. مبارك لهم.

ويشترك آل طباجة مع السادة آل يحيى العاملي بذات النتائج الجينية (SNPs) والأصول الجغرافيّة الواقعة في محيط سَهْل الخيام-مرجعيون العاملي، شمال منطقة أصبع الجليل (فلسطين المُحتلّة).

خريطة تداخل قضاءي النبطيّة ومرجعيون وبعض أسماء البلدات التابعة لهما والمحيطة بالسَهْل (جنوب لبنان):

Nabatieh-Marjeyoun.png

مواضيع متعلّقة: نتيجة شريحة FGC8712 للعاملي

سبأ وسليمان (ع)

كلمة “قوم” في القرآن الكريم:

لقد ذكر الله في كتابه المُبين أقواماً بأسمائهم، فقال عزّ من قائل:
عاد (قوم هود (ع)، أخاهم)
ثمود (قوم صالح (ع)، أخاهم)
مَدْين (أخاهم شُعيب (ع)، وقيل أهل مَدْين/أصحاب مَدْين للدلالة على إسم مدينة بدل قوم، كقول أهل يثرب و أصحاب الحِجر)
سبأ (قوم الإمرأة التي تَمْلِكهم – بلقيس)
قُريش (قوم خاتم الأنبياء (صلّى الله عليه وآله)، جاءت في صيغة المُخاطبة – قَوْمك) استمر في القراءة

نتيجة السادة النفاخ

ظهرت نتيجة عيّنة السادة النفاخ (من النجف الأشرف، وتعود بأصولها إلى منطقة الأحساء) مطابقة لمجوعة الخطّ “قطيفي-أحسائي-بصري”. مبارك لهم.

وتشترك العيّنة مع هذا الخطّ الكريم ب12 STRs، لا سيّما العلامتان المميّزتان:
DYS390 = 22
DYS389ii = 29

من الجّيد فحص الصحيفة FGC8712 للعيّنة في المستقبل.

مواضيع مُتعلّقة: التحوّر الفرعي ZS6404 ، إضافة 8 تحورات للصحيفة

عيّنة السادة آل عفتان الحذيفات الثانية

ظهرت نتيجة عيّنة ثانية للسادة آل عفتان الحذيفات (من قرية العُليا – نجد/الشرقيّة) موجبة للتحور الحسني المحضي الموسوي FGC8702. مبارك لهم.

كما فحصت هذه العيّنة bigY وسنعرض نتيجتها في المشجر الجيني لاحقاً، بإذن الله، ريثما ننتهي من قراءتها لدى Full Genomes. العينتان تشتركان بتحور واحد وهو 22238078.

وتعود أصول هذه العائلة الكريمة إلى حِلْف بني حسين في المدينة المنورة (الحجاز) وهم من ذرية السيد الجليل عبدالله الرضا بن موسى الجون بن عبدالله المحض بن الحسن المثنّى بن الإمام الحسن المجتبى عليهم السلام.

مواضيع متعلّقة: قراءة FGC لنتيجة الحذيفات ، نتيجة السادة الحذيفات

عائلة Güemes

ظهرت عيّنة من المكسيك تحمل إسم Güemes مطابقة مع STRs العديد من العيّنات العلوية والقرشية لدينا وبمسافة جينيّة تتراوح بين:

4-6 من أصل 67 STRs
8-10 من أصل 111 STRs

وهي مسافة قريبة جدّاً من مجموعتنا الجينيّة.

عائلة Güemes هي أسرة برجوازيّة شهيرة شاركت في غزو الأمريكيتين (كوبا والمكسيك والأرجنتين صعوداً إلى ألاسكا) إنطلاقاً من أسبانيا خلال القرنين XVI و XVII الميلادي ويعود أصولها إلى شمال أسبانيا وتحديداً منطقة Cantabria التابعة إلى مملكة قشتالة الأندلسيّة التاريخية (Reino de Castilla).

سنحدّد موقع هذه العيّنة الجيني بعد انضمامها للمشروع وترقية فحصها، إن شاء الله.

مواضيع متعلّقة:

https://en.wikipedia.org/wiki/Mart%C3%ADn_Miguel_de_G%C3%BCemes

https://en.wikipedia.org/wiki/Juan_Francisco_de_G%C3%BCeme

https://en.wikipedia.org/wiki/Juan_Vicente_de_Güemes,_2nd_Count_of_Revillagigedo

عدد التحورات أسفل FGC8712

يتراوح تعداد التحوّرات (SNPs) أسفل التحوّر الإبراهيمي FGC8712 بين 26 و 53 تحوّر للعينات الفاحصة BigY أو Y-Elite، وبمعدّل يبلغ 41.4 ± 5.4 تحوّر (تماماً كما يبدو في الرسم البياني).

ويختلف هذا العدد بين عيّنة وأخرى للأسباب التالية:
– نوعيّة الفحص وتغطيته
– مكان تواجد التحوّر على Chr-Y
– قوّة التحوّر ونوعه (SNP, MNP, INDEL)
– عدد الآباء في الخط الجيني الواحد
– توقيت خَلْق خَلِيّة الإبن الأولى خلال عُمر الأب (أوّله، منتصفه، أو آخره)

https://fgc8712.com/wp-content/uploads/2017/09/snp-counts.png

SNP Counts

قراءات في التحور FGC54257

بعد التعرّف على موضع التحور الحُسيني الموسوي الفرعي الكريم FGC54257 في المشجرين الجيني والعلوي، تبيّن لنا أنّ الأئمة محمد الباقر وجعفر الصادق وموسى الكاظم عليهم السلام ليس لهم تحوّرات مقروءة في المنطقة المغطّاة من Chr Y بفحصي FGC و BigY، تماماً كما هو الحال مع الإمام الحسن المُجتبى وابنه الحسن المُثنى عليهما السلام.

ونجد في هذه السلسلة من الآباء العلويين التالي:

  • الإمامين الحُسين وزين العابدين (ع) يختصّان بالتحوّر FGC30416
  • الأئمة الباقر والصادق والكاظم (ع) ليس لهم تحوّرات ظاهرة في التغطية الحالية
  • قد يرجع التحوّر FGC54257 إلى السيد عبدالله العوكلاني أو ابنه موسى الثاني

ملاحظة:

  1. اشتُهِر الإمام الحسين (ع) وحفيده السيد عبدالله العوكلاني بالتعقيب من إبن واحد، لذا يصعب تحديد حامل التحوّر الحقيقي بين الوالد والإبن.
  2. نحتاج مزيد من نتائج FGC54257 لدى الخطوط الحُسينيّة الموسويّة لتأكيد نظريّة عدم ظهور تحورات للأئمّة الثلاث (ع).

مواضيع متعلّقة: التحور العوكلاني FGC54257 ، الفحوصات الجينيّة وتغطيتها