شرح مُبسّط لكيفيّة الدخول إلى حساب العينة في شركة Family Tree DNA واستعمال واجهة المستخدم، للمفحوصين الجدد:

https://www.youtube.com/watch?v=aN70Cs0R9ig

والشكر موصول لمشروع السادة على هذا العمل.

بعد التغييرات الأخيرة التي تبنّتها شركة FTDNA، نرجو من أصحاب العيّنات في “مشروع قُريش وبني هاشم الجيني” (لا سيّما العيّنات القرشية والهاشميّة منها) أن يعطوا مُدراء المشروع الكرام خاصيّة Full Access للدخول إلى عيّناتهم ومتابعتها بشكل دقيق. ونحن نحيطكم علماً أنّ معلوماتكم الشخصيّة ستبقى في كامل السريّة المطلوبة. هذه الخاصيّة ستُتيح لنا التالي:

• رؤية نتائجكم كاملة وفهمها بطريقة صحيحة
• متابعة تطوير عيّناتكم
• قراءة ملفاتكم BAM و BigY
• إمكانيّة ترقية الفحص لعيّنتكم من طرفنا
• التواصل معكم بحُرّية

وهذه هي الطريقة لإعطائنا هذه الخاصّية في حساب عيّنتكم:

• Go to Privacy & Sharing
• Go to Project Preferences
• Click on Edit next to Quraysh project
• For every Admin, select Grant Full Access

هذه نبذة مختصرة عن تطوّر الفحوصات ومدى تغطيتها لدى شركتي Full Genomes و FTDNA.

FGC Test: Y Elite

FTDNA Test: Big Y

وكما تعلمون، فإنّ chromosome Y (بذراعيه p & q) يحتوي على حوالي 57.2 مليون bp (وهي وحدة جينية). وأحدث فحص لدى شركة FGC يغطي حوالي 40% من هذا الchromosome وهو فحص Y Elite 2.1. بينما نجد أنّ الأماكن الموثوقة والتي يتّم الإعتماد عليها في بناء المشجرات الجينية لا تزيد مساحتها عن 15 مليون bp (وهي التي تظهر باللون الأبيض في صورة chromosome Y أدناه) من ضمن التغطية العامّة.

مواقع 37 STRs على ChrY وقراءة تكرارها لدى الإمام علي عليه السلام:

وهذه قائمة كاملة بمواقع 111 STRs على ChrY وقراءتها (لا زالت قيد التحديث):

https://fgc8712.com/wp-content/uploads/2018/01/y-strs.png

ولا زال الأخ علي المشيخي يتربع المرتبة الأولى بين العلويّين بتقاربه الأقصى من STRs الإمام علي (ع) بنسبة 107/111 و 66/67 و 36/37.

وهذه ثلاثة أمثلة مُختصرة لمواقع بعض STRs على ChrY، بحسب شُهْرَتها:

استمر في القراءة ←

لإزالة أي نوع من الشبهات ومنعاً للتشويش على أصحاب العيّنات ومدى معرفتنا بهم، يودّ “مشروع قريش وبني هاشم الجيني” إحاطتكم بمصادر العينات المتواجدة لدينا إلى يومنا هذا.

وقد تمّ تقسيم هذه العيّنات إلى 4 مجموعات (بحسب مصدرها ومدى معرفتنا بأصحابها)، بالشكل التالي:

1. عيّنات فحصها المُشرفون على المشروع بأنفسهم عبر السعي الدؤوب خلف عوائل السادة الأشراف، وإنتقاء أبرز الأنساب العلويّة والهاشميّة وأصرحها.
2. عيّنات فرديّة دخلت المشروع وتمّ التواصل مع أصحابها والتعرف عليهم وعلى أنسابهم لاحقاً، وتربطنا بهم حالياً أطيب العلاقات وصلة الرحم.
3. عيّنات دخلت المشروع عبر المشاريع الأخرى الصديقة.
4. عيّنات فرديّة دخلت المشروع ويجري التواصل مع أصحابها.

وهذه قائمة تفصيلية بهذه العيّنات القرشيّة والهاشميّة ومصادرها:

https://fgc8712.com/wp-content/uploads/2018/01/kit.png

ملاحظة: المشروع يُعلن فقط عن العيّنات الهاشميّة والقرشيّة الموجبة لتحوراتنا الجينيّة، ولا يُعلن عن العيّنات السالبة بغضِّ النظر عن موروثها أو عددها.

التقنية المستخدمة في فحص Y-DNA لدى جميع الشركات (BigY & YElite):

 – Illumina Sequencing Technology

https://www.youtube.com/watch?v=womKfikWlxM

يوّد “مشروع قريش وبني هاشم الجيني” أن يحيطكم علماً بالتعليمات التالية:

1) نتمنى على جميع الأخوة الأعضاء في المشروع، الموجبين للتحوّر FGC8712 وما دونه أو الموجبين للتحوّر M267 ولهم تطابق STR قوي مع عيناتنا (بنسبة فوارق تقلّ عن 10%)، أن يحدّثوا معلومات عيناتهم بإضافة الإسم الكامل و إسم العائلة و المنطقة الجغرافية التي ينتمون إليها.
2) نتمنى على الأخوة الأعضاء الموجبين للتحوّر M267 ولهم تطابق STR قوي مع عيناتنا أن يحدّثوا نتائجهم بطلب المزيد من الفحوصات لعيّناتهم (على سبيل المثال، الترقية بطلب التحور FGC8712 أو L859 أو FGC10500 أو الصحيفة الإبراهيميّة FGC8712 Pack). وهذا يقطع طريق الشك والتخريب على الكثير من العابثين.
3) نتمنى على الأخوة الأعضاء أن يتواصلوا معنا، قدْر الإمكان، لكي نتعرّف عليهم بشكل أفضل ونبني بيننا وبينهم جسور الثقة و الإحترام و صلة الرحم.
4) نُحذّر الأخوة الأعضاء من التلاعب بأسماء العوائل وإلصاق النسب العلوي أو القرشي بأسماء عوائل غير صحيحة أو سالبة لتحوراتنا الجينيّة.
5) يحتفظ المشروع بحقّه لعدم عرض أو طرد أي عيّنة نشك في إسمها المُعلن، وخاصّة مع رفض أصحابها الإجابة على مراسلتنا.

ملاحظة:
1) نستثني من هذه القواعد الأخوة الضيوف السالبون لتحوراتنا.
2) غالبيّة الأخوة الأعضاء تنطبق عليهم هذه القوانين ولكن أحببنا التأكّد من خضوع جميع الأعضاء لنفس المعايير.

والله الموفّق…

لقد حدّثت شركة FTDNA من منظومة مواقع ChrY لديها واعتمدت الكيان الجديد hg38 بدلاً من الكيان القديم hg19. كذلك تمّ اعتماد هذا الكيان الجديد لدى مجتمع ISOGG الجيني وشركة YFull. هذا التغيير سيمنحنا المزيد من الدقة في قراءة التحورات، ولكنه سيغيّر مواقع الأخيرة كُلّياً على ChrY.

وبما أنّ شركة FGC لم تعتمد هذا التحديث إلى الآن (ونظنّها ستعتمده لاحقاً)، سنضّطر لإستعمال و عرض القراءتين القديمة والجديدة في آن معاً عند إنشاء المشجر الجيني.

ولمعرفة مواقع هذه التغيّرات في ChrY، يمكنكم قراءة هذا الرابط:

http://www.ytree.net/hg19tohg38.html

فعلى سبيل المثال، تتغيّر مواقع التحورات الخاصة بنا بين الكيانين (hg19 و hg38) على ChrY بالشكل التالي:

hg38 – الكيان الجديد	hg19 – الكيان القديم
15,272,075	17,383,955	FGC8712 / G > A
13,908,470	16,020,350	L859 / G > A
7,523,736	7,391,777	FGC8703 / A > G
20,706,147	22,868,033	FGC10500 / T > C
20,980,021	23,141,907	FGC30416 / T > C

ولتحويل مواقع تحوّرات ChrY كاملةً بين الكيانين hg19 و hg38، يمكنكم إستعمال هذا الرابط:

http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgLiftOver

تعريف مصطلحات:

GRCh38 = Genome Reference Consortium Human Reference 38 = human genome 38 = hg38

GRCh Build 37 = hg19

مجتمع ISOGG الجيني:

http://ybrowse.org/gb2/gbrowse/chrY

الصورة (أدناه) توضح أماكن تغطية الفحص الجيني (BigY أو FGC) على Chromosome-Y. كما أنّها تُظهر مواقع التحورات العلوية والحسنيّة والحُسينية على طول إمتداد ذراعيه (p & q).

التغطية لا تزيد عن 40% من طول Chromosome-Y في أقصى حدودها، وهي 24.5 مليون bp.

https://fgc8712.com/wp-content/uploads/2017/07/chry-coverage.png

مواضيع متعلّقة: BigY vs FGC