لا زالت فحوصات full Y genome sequencing 30X لدى شركة YSEQ تتربّع على عرش أوسع تغطية أفقيّة وعاموديّة على شريط الحمض النووي الذكوري ChrY بالمقارنة مع باقي الفحوصات لدى شركتي (FTDNA (Bigy500 & BigY700 و (FGC (Y-Elite.
وهذه مقارنة بسيطة بين ملفات BAM لثمان عيّنات لدينا في المشروع (محضيّة -الحذيفات- وطباطبائيّة وعلوية -طباجة والقديمي- وحسينيّة -رضويّة وموسويّة- واثنتين خزريّة) تبرز الفوارق الكبيرة في التغطية بين الفحوصات الأربع:
https://fgc8712.files.wordpress.com/2019/07/y-sequencing.png
كما تُبرز هذه المقارنة الفرق الشاسع بين BigY500 و BigY700 بعد تطوير الفحص ليُصبح لا فرق بينه وبين فحص FGC YElite.
ملاحظة:
- ملف BAM من YSEQ يعود إلى عيّنة السادة الحذيفات.
- المقارنة في الرسم أعلاه تظهر إحدى مناطق التغطية الصعبة في حدود 3MM bp.
- المقارنة لم تشمل فحوصات Long Read لدى FGC أو نتائج Dante Labs.
- قد تتفاوت هذه التغطية أيضاً بشكل جذري بين الفحوصات الأربع بحسب موقع القراءة.
- الهدف الرئيسي من هذا العمل هو استخراج تحوّر جامع للسادة الحسنيّين.