Y-DNA tests

شموليّة تغطية الفحوصات

لا زالت فحوصات full Y genome sequencing 30X لدى شركة YSEQ تتربّع على عرش أوسع تغطية أفقيّة وعاموديّة على شريط الحمض النووي الذكوري ChrY بالمقارنة مع باقي الفحوصات لدى شركتي (FTDNA (Bigy500 & BigY700 و (FGC (Y-Elite.

وهذه مقارنة بسيطة بين ملفات BAM لثمان عيّنات لدينا في المشروع (محضيّة -الحذيفات- وطباطبائيّة وعلوية -طباجة والقديمي- وحسينيّة -رضويّة وموسويّة- واثنتين خزريّة) تبرز الفوارق الكبيرة في التغطية بين الفحوصات الأربع:

https://fgc8712.files.wordpress.com/2019/07/y-sequencing.png

Y Sequencing

كما تُبرز هذه المقارنة الفرق الشاسع بين BigY500 و BigY700 بعد تطوير الفحص ليُصبح لا فرق بينه وبين فحص FGC YElite.

ملاحظة:

  1.  ملف BAM من YSEQ يعود إلى عيّنة السادة الحذيفات.
  2. المقارنة في الرسم أعلاه تظهر إحدى مناطق التغطية الصعبة في حدود 3MM bp.
  3. المقارنة لم تشمل فحوصات Long Read لدى FGC أو نتائج Dante Labs.
  4. قد تتفاوت هذه التغطية أيضاً بشكل جذري بين الفحوصات الأربع بحسب موقع القراءة.
  5. الهدف الرئيسي من هذا العمل هو استخراج تحوّر جامع للسادة الحسنيّين.